Η. Influenzae - gram-αρνητικά ποντομορφικά σχήματος ράβδου ή κοκκοειδή κύτταρα με μέτρηση (0,2-0,3) χ (0,5-2) μm. Βρίσκονται σε εγκεφαλικά επεισόδια μεμονωμένα ή σε ζεύγη, και μερικές φορές με τη μορφή μικρών αλυσίδων και ομάδων. Σε πυκνά μέσα, σχηματίζονται μικρές (μέχρι 1 mm σε διάμετρο) στρογγυλές, άχρωμες αποικίες. Οι μικροοργανισμοί είναι ακίνητοι, δεν σχηματίζουν σπόρια, αλλά είναι δυνατός ο σχηματισμός καψιδικών μορφών με τους οποίους δεσμεύουν τις παθογόνες ιδιότητες. Ο αιτιολογικός παράγοντας παράγει ενδοτοξίνη, ο φορέας του οποίου θεωρείται καψιδικοί πολυσακχαρίτες.
