Σε ορισμένες περιπτώσεις, πιο συχνά στις γυναίκες, η οξεία πυελονεφρίτιδα ξεκινά με οξεία κυστίτιδα (συχνή και επώδυνη ούρηση, πόνος στην ουροδόχο κύστη, αιματουρία στο τελικό στάδιο). Άλλα συμπτώματα οξείας μυελονεφρίτιδας: γενική κόπωση, αδυναμία, μυϊκοί και πονοκέφαλοι, απώλεια όρεξης, ναυτία, έμετος.