Σε ορισμένες περιπτώσεις, συχνότερα στις γυναίκες, η οξεία πυελονεφρίτιδα ξεκινά με οξεία κυστίτιδα (συχνή και οδυνηρή ούρηση, πόνος στην ουροδόχο κύστη, τερματική αιματουρία). Άλλα συμπτώματα οξείας μυελονεφρίτιδας: γενική αδυναμία, αδυναμία, μυϊκοί και πονοκεφάλοι, έλλειψη όρεξης, ναυτία, έμετος.