Αλλοειδής, ή ισόνομη, ουδετεροπενία νεογέννητων συμβαίνει στο έμβρυο λόγω της αντιγονικής ασυμβατότητας των ουδετερόφιλων του εμβρύου και της μητέρας. Τα ισοένζυμα της μητέρας ανήκουν στην τάξη IgG, διεισδύουν στο φραγμό του πλακούντα και καταστρέφουν τα ουδετερόφιλα του παιδιού. Τα ισότοπα είναι συνήθως λευκογλουτινίνες, αντιδρούν με τα κύτταρα του ασθενούς και τον πατέρα του, δεν αντιδρούν με τα κύτταρα της μητέρας.