Ο παθογόνος παράγοντας της πανώλης είναι μια μικρή, πολυμορφική σταθερή ακινητοποιημένη ράβδος Yersinia pestis της οικογένειας Enterobacteriaceae του γένους Yersinia. Έχει βλεννώδη κάψουλα, δεν σχηματίζει σπόρο. Προαιρετική αναερόβια. Είναι χρωματισμένο με διπολικές βαφές ανιλίνης (πιο έντονα γύρω από τις άκρες). Απομονώστε αρουραίους, γαιοσκώληκες, gopher, πτήση και αμμώδεις ποικιλίες βακτήρια πανώλης.