Οι όγκοι του λεπτού εντέρου αντιπροσωπεύουν το 1-5% των γαστρεντερικών όγκων. Οι καλοήθεις όγκοι περιλαμβάνουν λειομυώματα, λιπώματα, νευρινώματα και ινομυώματα. Όλα μπορούν να προκαλέσουν φούσκωμα, πόνο, αιμορραγία, διάρροια και, εάν αποφραχθούν, έμετο. Οι πολύποδες δεν είναι τόσο συνηθισμένοι όσο στο παχύ έντερο.