Οι ανωμαλίες της χοληφόρου οδού και του ήπατος μπορούν να συνδυαστούν με άλλες συγγενείς ανωμαλίες, συμπεριλαμβανομένων των καρδιακών παθήσεων, της πολυδεκτίνης και της πολυκυστικής νεφρικής νόσου. Η ανάπτυξη ανωμαλιών της χολικής οδού μπορεί να συσχετιστεί με ιογενείς λοιμώξεις στη μητέρα, για παράδειγμα με ερυθρά αιμοσφαίρια.