Αλοιφή στοματίτιδα δημιουργεί για φλεγμονή εστία είδος της προστατευτικής μεμβράνης, σύμφωνα με την οποία υπάρχει επιθηλίωση των κατεστραμμένων ιστών, επιπλέον, πολλά από τα φάρμακα είναι συστατικό αντιβακτηριακή αλοιφή που δημιουργεί την ευκαιρία να επηρεάσουν πολλές παθολογικές διεργασίες ταυτόχρονα.