Η κλινική διάγνωση είναι αξιόπιστη μόνο με λοβού πνευμονία, αλλά η πιθανότητα μιας πνευμονιόκοκκου αιτιολογία της πνευμονίας της κοινότητας, μέση ωτίτιδα, ιγμορίτιδα είναι περίπου 60-80 °. Επιβεβαιώστε τη διάγνωση μπορεί να βασίζεται μόνο στα αποτελέσματα των μικροβιολογικών μελετών που αντιστοιχεί biosubstrate: ρινίτιδα - ρινικό έκκριμα (εγκεφαλικό επεισόδιο), με ωτίτιδα, ιγμορίτιδα - πυώδη εξίδρωμα, με πνευμονία - πτύελα, μηνιγγίτιδα - εγκεφαλονωτιαίο υγρό.