Το γονιδίωμα του HCV αντιπροσωπεύεται από ένα μονόκλωνο θετικά φορτισμένο RNA, το οποίο κωδικοποιεί 3 δομικές (πυρήνας πρωτεΐνης νουκλεοκαψιδίου και νουκλεοπρωτεΐνες του περιβλήματος E1-E2) και 5 δομικές (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) πρωτεΐνες. Οι αντισώματα κατά του ιού (ATs) συντίθενται για καθεμία από αυτές τις πρωτεΐνες, οι οποίες βρίσκονται στο αίμα ασθενών με ιογενή ηπατίτιδα C.