Ο προσδιορισμός της Χ- και Υ-χρωματίνης συχνά ονομάζεται μέθοδος ταχείας διάγνωσης του φύλου. Εξετάζονται τα κύτταρα του στοματικού βλεννογόνου, του κολπικού επιθηλίου ή του θύλακα της τρίχας. Στους πυρήνες των θηλυκών κυττάρων, υπάρχουν δύο χρωμοσώματα Χ στο διπλοειδές σύνολο, ένα από τα οποία είναι πλήρως απενεργοποιημένο (σπειροειδές, σφιχτά συσκευασμένο) ήδη στα πρώιμα στάδια της εμβρυϊκής ανάπτυξης και είναι ορατό ως ένα κομμάτι ετεροχρωματίνης προσαρτημένο στη μεμβράνη του πυρήνα.
