Στο έντερο ενός υγιούς ατόμου, υπάρχει μια ορισμένη ισορροπία μεταξύ των μικροοργανισμών που το κατοικούν. Η συντριπτική πλειοψηφία των βακτηρίων (99%) είναι χρήσιμες εκπρόσωποι της εντερικής μικροχλωρίδας - είναι bifidobacteria, Bacteroides, Lactobacillus, Escherichia coli και εντερόκοκκοι.