Η συμπερίληψη RNA ξενιστή συνδέεται με τη χρόνια λοίμωξη από ηπατίτιδα Ε

Εάν ο ιός ενσωματώσει τμήματα του γονιδιώματος του ξενιστή στη γενετική του σύνθεση, η μόλυνση μπορεί να γίνει χρόνια.

• Γιατί η ηπατίτιδα Ε γίνεται χρόνια σε ορισμένους ασθενείς και γιατί τα φάρμακα δεν έχουν αποτέλεσμα;

Για να το ανακαλύψει, μια διεθνής ομάδα ερευνητών με επικεφαλής επιστήμονες από το Μπόχουμ παρατήρησε έναν ασθενή με χρόνια λοίμωξη από ηπατίτιδα Ε για ένα χρόνο. Ο επαναπροσδιορισμός της αλληλουχίας του ιικού RNA έδειξε ότι ο ιός είχε ενσωματώσει διάφορα μέρη του mRNA του ξενιστή στο γονιδίωμά του. Αυτό είχε ως αποτέλεσμα ένα πλεονέκτημα αναπαραγωγής που θα μπορούσε να συμβάλει στη χρονιότητα της λοίμωξης.

• Η ενεργοποίηση του RNA ξενιστή μπορεί να προβλέπει τη μετάβαση από οξεία σε χρόνια λοίμωξη

Ο Δρ. Daniel Todt, Επικεφαλής της Ερευνητικής Ομάδας Υπολογιστικής Ιολογίας, Τμήμα Ιατρικής και Μοριακής Ιολογίας, Πανεπιστήμιο Ruhr Bochum, Γερμανία

Ερευνητές ανέφεραν αυτό στο περιοδικό Nature Communications.

• Αλληλουχία του ιικού πληθυσμού

Περίπου 20 εκατομμύρια άνθρωποι παγκοσμίως μολύνονται από ηπατίτιδα Ε κάθε χρόνο. Η μόλυνση συνήθως περνά χωρίς συνέπειες, αλλά μπορεί να είναι απειλητική για τη ζωή για έγκυες γυναίκες ή άτομα με εξασθενημένο ανοσοποιητικό σύστημα. Σε ορισμένες περιπτώσεις, γίνεται χρόνια. Δεν υπάρχουν συγκεκριμένα αποτελεσματικά φάρμακα. Το ευρέως φάσματος αντιιικό φάρμακο ριμπαβιρίνη χρησιμοποιείται επίσης κατά της ηπατίτιδας Ε, αλλά δεν λειτουργεί πάντα.

• Πώς ο ιός διαφεύγει από το ανοσοποιητικό σύστημα; Γιατί η μόλυνση γίνεται χρόνια και δεν υποχωρεί;

Ερευνητές ανέλυσαν για πρώτη φορά ολόκληρους τους ιικούς πληθυσμούς ενός ασθενούς με χρόνια μόλυνση για περισσότερο από ένα χρόνο. Μελέτησαν λεπτομερώς περισσότερες από 180 μεμονωμένες αλληλουχίες από δείγματα αίματος.

• Αντιγραφή σε κυτταρική καλλιέργεια με χρήση RNA ξενιστή

"Ο ιός της ηπατίτιδας Ε έχει μια λεγόμενη υπερμεταβλητή περιοχή στις γενετικές του πληροφορίες, στην οποία μπορεί να ενσωματώσει διαφορετικές αλληλουχίες RNA από τα κύτταρα-ξενιστές", εξηγεί ο Daniel Todt. Η ομάδα του μπόρεσε να δείξει ότι η σύνθεση αυτής της περιοχής άλλαξε σημαντικά κατά την περίοδο παρατήρησης. Επιπλέον, πολλές διαφορετικές συνθέσεις προέκυψαν ταυτόχρονα. Σε πειράματα κυτταροκαλλιέργειας, αποδείχθηκε ότι η ενσωμάτωση του RNA ξενιστή παρείχε ένα πλεονέκτημα αντιγραφής: οι τροποποιημένοι ιοί ήταν σε θέση να αναπαραχθούν καλύτερα από άλλους. "Υποπτευόμαστε ότι αυτό είναι εν μέρει υπεύθυνο για τη χρονιότητα της λοίμωξης και την αποτυχία της θεραπείας", λέει ο Daniel Todt.

• Μελέτη του RNA ξενιστή που έχει ενσωματωθεί στον ιό

Οι ερευνητές ανέλυσαν τη σύνθεση του RNA του ξενιστή που ενσωματώθηκε στον ιό για να προσδιορίσουν εάν υπήρχαν κοινά χαρακτηριστικά που χαρακτηρίζουν τα γενετικά τμήματα. «Ωστόσο, δεν μπορέσαμε να βρούμε σημαντικές ομοιότητες», λέει ο Τοντ. Οι γονιδιακές αλληλουχίες που περιλαμβάνονται είναι ως επί το πλείστον εκείνες που είναι πολύ κοινές στα κύτταρα ξενιστές, υποδεικνύοντας τυχαία επιλογή.

• "Είναι πιθανό ότι κατά τη διάρκεια της μόλυνσης από ηπατίτιδα Ε, υπάρχει μια κούρσα μεταξύ του ιού και του ανοσοποιητικού συστήματος στο σώμα", προτείνει ο Daniel Todt.

Εάν ο ιός καταφέρει να συμπεριλάβει το RNA του ξενιστή προτού το ανοσοποιητικό σύστημα καταπολεμήσει επιτυχώς τη μόλυνση, αυτό μπορεί να οδηγήσει σε χρονιότητα. "Το RNA του ξενιστή στο γονιδίωμα του ιού μπορεί, σε κάθε περίπτωση, να χρησιμεύσει ως βιοδείκτης στην οξεία φάση της μόλυνσης, υποδεικνύοντας την πρώιμη πιθανότητα χρονιότητας."

• Σχεδιασμός περαιτέρω μελετών

Οι ερευνητές σχεδιάζουν να επεκτείνουν τις μελέτες τους σε μεγαλύτερες ομάδες ασθενών.